Resume : La conquête de l'Univers ! Telle est en gros la trame principale de "Il était une fois... l’Espace". Dans le futur, nos amis bien connus, Maëstro, Pierrot, Petit Gros, accompagnés des nouveaux venus Psi (Mercedes de son vrai prénom) et le robot Métro, vont aller d'aventures en aventures, de planète en planète, il sera question de préhistoire, d’écologie, de nouvelles ressources d’énergie, etc. Ils seront notamment confrontés à la terrible confédération de Cassiopée, menée par l'ambitieux Teigneux et son sbire le Nabot.
A la fin de la série, une terrible guerre se prépare entre deux peuples, mais alors que tout semble perdu, nos amis seront aidés par des êtres supérieurs, venus on ne sait d’où...