Resume : L'histoire débute sur une île minuscule, qui abrite une toute petite communauté. Un beau jour, le facteur apporte un étrange paquet et, personne ne trouvant le destinataire, la communauté décide d'ouvrir celui-ci... A l'intérieur se trouve un petit enfant, qui est alors rapidement adopté.
Mais un problème va vite se poser : le bébé mystérieux grandit et il n'y aura hélas pas de place pour lui sur l'île. La décision de supprimer Emma, la petite locomotive de Lucas le conducteur de train, est alors prise.
Lucas, déprimé par cette situation, décide de quitter définitivement l'île et transforme sa locomotive en bateau, avec lequel il prend le large... Mais Jim, qui avait eu vent de ses projets, et touché par la détresse de Lucas, décide de quitter lui aussi l'île et embarque avec son ami.
Ils vont vivre ensemble de nombreuses aventures, et délivrer la petite princesse Li Si, retenue prisonnière dans la mystérieuse cité des dragons. Ils vont aussi petit à petit en apprendre plus sur les origines de Jim, et affronter la terrible Mme Mahlzahn, la reine dragon, sans oublier les terribles 13, une bande de pirates, et des dizaines d'autres dangers inquiétants...